Als Zweckverband von 17 Gemeinden aus zwei Kantonen betreibt der AVA die Siedlungsentwässerung, die Schmutzwasser- und Schlammbehandlung.
Die topographischen Verhältnisse unterscheiden sich stark von vorwiegend flach in den nördlich gelegenen St. Galler Gemeinden bis voralpin in den südlich gelegenen Appenzeller Gemeinden.
Die Verbandsgemeinden betreiben die Siedlungsentwässerung etwa hälftig im Misch- und Trennsystem. Der Anschlussgrad beträgt über 99%. Das gereinigte Wasser gelangt über das Mündungsgebiet des Alten Rheins in den Bodensee. Sowohl Bodensee als auch der Alte Rhein gelten als vorrangig zu schützende Gewässer. Der Bodensee dient gleichzeitig als Trinkwasserspeicher, Badegewässer und Naherholungsgebiet.
Das Kanalnetz umfasst zirka 340 km Schmutzwasserkanäle. Hinzu kommen 165 Sonderbauwerke, 90 Pumpstationen, 30 Regenüberläufe, über 20 Regenbecken, Messstationen, Düker, Stollenwehre, ein Wirbelabscheider und ein Wirbelfallschacht.